Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4BQ92750 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF4BQ92750 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms