Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSKUQ8WUA8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms