Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms