Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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TTC21AQ8NDW8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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TTC21AQ8NDW8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTC21AQ8NDW8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
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TTC21AQ8NDW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
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TTC21AQ8NDW8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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TTC21AQ8NDW8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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TTC21AQ8NDW8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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TTC21AQ8NDW8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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TTC21AQ8NDW8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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TTC21AQ8NDW8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
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TTC21AQ8NDW8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC21AQ8NDW8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
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