Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARRDC4Q8NCT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARRDC4Q8NCT1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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