Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSGALNACT2Q8N6G5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSGALNACT2Q8N6G5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms