Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVBPQ8N300 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms