Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLF2Q8IX21 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms