Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LCA5Q86VQ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms