Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEGR1Q7Z3B1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEGR1Q7Z3B1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms