Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
H2AFVQ71UI9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms