Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
USP43Q70EL4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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