Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00322Q6ZN03 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00322Q6ZN03 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms