Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HACD2Q6Y1H2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HACD2Q6Y1H2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms