Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SHISA2Q6UWI4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms