Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LCN8Q6JVE9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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LCN8Q6JVE9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LCN8Q6JVE9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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