Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms