Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
TNS3Q68CZ2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNS3Q68CZ2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms