Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USPL1Q5W0Q7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms