Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms