Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PXDC1Q5TGL8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PXDC1Q5TGL8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms