Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC18Q5T9S5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms