Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms