Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP28Q4G0W2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms