Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01559Q495D7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01559Q495D7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms