Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P3H1Q32P28 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P3H1Q32P28 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms