Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WHAMMP3Q1A5X7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WHAMMP3Q1A5X7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms