Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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SSX2Q16385 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SSX2Q16385 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
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SSX2Q16385 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SSX2Q16385 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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SSX2Q16385 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSX2Q16385 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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