Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSX1Q16384 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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SSX1Q16384 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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SSX1Q16384 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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SSX1Q16384 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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SSX1Q16384 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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SSX1Q16384 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX1Q16384 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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