Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NTRK3Q16288 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NTRK3Q16288 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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