Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK4Q16099 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK4Q16099 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms