Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms