Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRK1Q15835 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms