Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAM1Q15629 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM1Q15629 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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