Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN1Q14457 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN1Q14457 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN1Q14457 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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