Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EXOSC2Q13868 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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