Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF4BQ13523 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
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