Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MKRN3Q13064 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MKRN3Q13064 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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