Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNH2Q12809 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNH2Q12809 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms