Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RIPPLY1Q0D2K3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms