Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM27E3Q08E93 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms