Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RAD51Q06609 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD51Q06609 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms