Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTDSPL2Q05D32 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTDSPL2Q05D32 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms