Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN1Q05586 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN1Q05586 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms