Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCZQ05513 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCZQ05513 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms