Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EGR4Q05215 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EGR4Q05215 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms