Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BDH1Q02338 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BDH1Q02338 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BDH1Q02338 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BDH1Q02338 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BDH1Q02338 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BDH1Q02338 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BDH1Q02338 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BDH1Q02338 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BDH1Q02338 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BDH1Q02338 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms