Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MC1RQ01726 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms