Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DEFA5Q01523 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEFA5Q01523 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms