Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAP1Q01518 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CAP1Q01518 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAP1Q01518 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAP1Q01518 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAP1Q01518 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAP1Q01518 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAP1Q01518 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms